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无需抗体的酶辅助化学标记N6-甲基腺嘌呤(m6A)测序技术
随着首个RNA修饰N6-甲基腺嘌呤(m6A)的去修饰酶FTO的发现,RNA表观遗传学/表观转录组学开始兴起并成为表观遗传学新的研究热点。m6A作为首个被发现的可逆RNA修饰,广泛存在于mRNA,依赖修饰酶、去修饰酶和结合蛋白发挥调控功能。已发现m6A具有调控mRNA剪接、出核、稳定性和蛋白翻译等功能,可以参与发育、配子发生、细胞重编程、生物节律、疾病等多种生理和病理过程的功能调控。为了更好地研究m6A生物功能和临床病理研究,开发m6A高通量测序技术一直是研究的热点。 现有m6A测序技术主要依赖于m6A抗体富集技术,包括低分辨率的m6A-seq/MeRIP-seq和联用iCLIP或PAR-CLIP技术的高分辨率m6A测序技术miCLIP 或PA-m6A-seq。抗体存在对特定RNA序列或结构的潜在非特异性结合,为了解决抗体方法的种种问题,研究者们做出了各种尝试,近期开发了两类无需抗体的m6A测序技术,一类为利用对特定甲基化序列(m6ACA)敏感的RNA核酸内切酶MazF辅助的测序方法(m6A-REF-seq or MAZTER-seq),此类方法只能检测16~25%的m6A位点;另一种是在细胞内表达融合m6A-binding domain(YTH)与胞嘧啶脱氨酶(APOBEC1)的融合蛋白实现的m6A测序(DART-seq),但该方法依赖于细胞转染效率且受限于体外样品的使用。 贾桂芳课题组一直致力于开发和利用核酸化学生物学技术研究RNA化学修饰在动植物中的生物功能研究。在本课题中,贾桂芳课题组巧妙地利用m6A的去甲基酶FTO蛋白作为催化剂,将mRNA上化学惰性的m6A转化为高反应活性的中间态产物N6-羟甲基腺嘌呤(hm6A),然后利用二硫苏糖醇(DTT)的巯基与hm6A发生亚胺1,2加成反应,将不稳定的hm6A转化为更稳定的巯基加成产物dm6A。dm6A上的自由巯基可以与甲烷硫代磺酸(methanethiosulfonate,MTSEA)快速反应,实现在mRNA上m6A的位置标记生物素Biotin,最终可被链霉亲和素珠捕获,从而富集含有m6A修饰的RNA片段供后续高通量测序使用。
北京大学 2021-04-11
一种基于免疫遗传算法的模块化多电平变换器的调制方法
本发明涉及一种基于免疫遗传算法的模块化多电平变换器的调制方法,对模块化多电平变换器的优化控 制方面的问题进行研究,优化目标为模块化多电平变换器的输出电流波形最优,本发明结合模块化多电平变 换器的结构特点和输出特性,采用各相上桥臂投入子模块的数目表示工作状态,对模块化多电平的工作状态 进行优化,通过编码操作,注入疫苗,亲和度计算,浓度计算,免疫选择,交叉操作,变异操作,倒位操作, 经过多次迭代收敛后得到优化后的模块化多电平变换器的输出电压阶梯波。
武汉大学 2021-04-14
簇生朝天椒可育胞质的分子鉴定标记及保持系选育方法
本发明提供了簇生朝天椒可育胞质的分子鉴定标记及保持系选育方法,本发明首先利用种子培育簇生朝天椒优良品种的黄化苗,提取线粒体DNA,然后依据本发明的分子标记Mt_InDel10,筛选具有可育胞质基因型N的品种;最后以100%雄性不育系材料与入选的具有可育胞质基因型N的品种,花期杂交,根据杂交后代育性分离情况,快速选育具有优良表观性状的雄性不育系和保持系,为雄性不育三系配套杂交育种提供母本储备。本发明所述的选育方法将分子标记筛选和常规杂交育种结合,减少了常规选育的盲目性,缩短选育年限,提高定向选择效果,加快育种进程,对加快簇生朝天椒优良地方品种的改良和提升具有重要应用价值。
青岛农业大学 2021-04-13
与苹果抗炭疽菌叶枯病基因位点紧密连锁的分子标记及应用
本发明提出一种与苹果抗炭疽菌叶枯病基因位点紧密连锁的分子标记及其应用,分子标记包括6个SNP标记以及5个InDel标记,分别为SNP3955,SNP4236,SNP4257,SNP4299,SNP4336,SNP4432,InDel4199,InDel4227,InDel4254,InDel4305及InDel4334。此外,本发明还提出筛选该标记的方法,以及上述标记的应用。本发明利用全基因组重测
青岛农业大学 2021-01-12
一种用于检测奶牛四种遗传病的核酸质谱的检测产品及应用
本发明公开了一种可以同时检测奶牛是否具有脊椎畸形综合症(CVM)、白细胞粘附缺陷症(BLAD)、尿苷酸合酶缺乏症(DUMPS)、瓜氨酸血症(CN)四种遗传病的引物系统。基于该引物系统所制备的产品,能实现同时对奶牛CVM、BLAD、DUMPS、CN四种遗传病基因相关的4处多态性位点进行检测。此外,本发明还公开了能够同时联合检测以上遗传病和奶牛A2基因型的检测方法及其检测产品,该联合检测的结果可用于指导健康奶牛的筛选、育种等。
中国农业大学 2021-04-11
一种制备胶体金标记的装载有PD药物的纳米脂质体的方法
本发明公开了一种制备胶体金标记的装载有PD药物的纳米脂质体的方法。将卵磷脂;胆固醇乙醇溶液在特定条件下分散到含胶体金和左旋多巴或金刚烷胺PD治疗药物的PBS溶液中,再将该溶液置于水浴中搅拌,乙醇挥发完全之后适当超声制备而成。所制备的胶体金标记的装载PD药物纳米脂质体粒径小、稳定性好,且有金定位标记,可增加PD药物的稳定性,提高生物利用率,同时减少药物用量,降低毒性。制备方法操作简便,反应易控制。产物可用于研究纳米左旋多巴或金刚烷胺脂质体的给药效果,改善左旋多巴或金刚烷胺的毒副作用,增强脑靶向性,还可作为一种探针用于研究纳米脂质体的脑代谢途径。
河北师范大学 2021-05-03
5-醛基胞嘧啶的标记方法及其在单碱基分辨率测序中的应用
本项目采用化学生物学手段,筛选出特异性成环标记5-醛基胞嘧啶(5fC)的化合物——叠氮茚二酮和丙二腈,并且标记产物在随后的PCR扩增过程实现胞嘧啶(C)到胸腺嘧啶(T)的转变,可实现全基因组5-醛基胞嘧啶的单碱基分辨率检测。用叠氮茚二酮标记作为标记化合物,可实现对含有5-醛基胞嘧啶DNA片段的先富集再测序,将测序成本大大降低。用生物相容性很好的丙二腈作为标记化合物,可实现单细胞水平的5-醛基胞嘧啶单碱基分辨率检测。血液中细胞外游离DNA上的核酸修饰可以作为人类癌症的生物标记物,本项目涉及的核酸修饰检测技术,不会造成DNA降解,适应于临床小量珍贵样品,在癌症的液态活检上具有重大潜力。
北京大学 2021-02-01
5-醛基胞嘧啶的标记方法及其在单碱基分辨率测序中的应用
本项目采用化学生物学手段,筛选出特异性成环标记5-醛基胞嘧啶(5fC)的化合物——叠氮茚二酮和丙二腈,并且标记产物在随后的PCR扩增过程实现胞嘧啶(C)到胸腺嘧啶(T)的转变,可实现全基因组5-醛基胞嘧啶的单碱基分辨率检测。用叠氮茚二酮标记作为标记化合物,可实现对含有5-醛基胞嘧啶DNA片段的先富集再测序,将测序成本大大降低。用生物相容性很好的丙二腈作为标记化合物,可实现单细胞水平的5-醛基胞嘧啶单碱基分辨率检测。血液中细胞外游离DNA上的核酸修饰可以作为人类癌症的生物标记物,本项目涉及的核酸修饰检测技术,不会造成DNA降解,适应于临床小量珍贵样品,在癌症的液态活检上具有重大潜力。
北京大学 2021-01-12
南京大学医学院石云课题组揭示人类攻击行为的遗传机制
突触前神经元释放的谷氨酸结合并激活突触后膜的AMPA型谷氨酸受体,介导离子的流动,改变突触后神经元的电活动,从而将神经信号从一个神经元(突触前)传递给下一个神经元(突触后),因而AMPA受体在人类行为、认知、情感等各种神经活动中起关键作用。
南京大学 2022-06-14
生命科学学院课题组Cell子刊:纳米光遗传学取得新进展
利用肠道工程菌及其代谢产物,创制新一代“生物活药”,用于增强机能、治疗疾病,已成为生物医药科学领域的前沿研究热点。其中,如何无创精准在体调控工程菌定植及给药,一直是工程菌生物医学应用转化的难点之一。
天津大学 2021-09-23
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