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一种估计基因组育种值的方法及装置
本发明实施例提供一种估计基因组育种值的方法及装置，该方法包括：根据矩阵M‑1的子块数和预设的MPI进程数n，确定MPI进程MPIi读取的根据表型数据文件的记录条数、矩阵A‑1中的个体数和所述MPI进程数n，确定MPI进程MPIi读取的系数矩阵Wi和根据MPI进程MPIi的系数矩阵Wi和确定待估计的基因组育种值。本发明实施例可以实现计算机资源与运算速度的最优化，节约运算时间，提高工作效率。
中国农业大学
2021-04-11
一种小麦抗穗发芽基因TaZFP18及其应用
项目成果/简介:本发明公开了一种小麦抗穗发芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含与SEQ?ID?NO.1序列互补的核苷酸序列,该基因编码CCCH型锌指蛋白18,可作为小麦穗发芽抗感品种的分子标记基因.该小麦抗穗发芽基因TaZFP18为一种新的小麦抗穗发芽主效基因,利用其开发分子标记,可以迅速鉴定小麦是否为穗发芽抗性品种,也为小麦穗发芽抗性育种提供了新的基因资源.
安徽农业大学
2021-04-10
基因放疗引起放射性脑损伤相关SNP标志物
放疗是鼻咽癌首选的治疗方式，而放疗引起的放射性脑损伤是鼻咽癌患者最严重的晚期不良反应之 放疗是鼻咽癌首选的治疗方式，而放疗引起的放射性脑损伤是鼻咽癌患者最严重的晚期不良反应之 一。该不良反应往往具有不可逆性，极大地影响患者的生活质量。放射性脑损伤一旦发生，治疗颇为困 一。该不良反应往往具有不可逆性，极大地影响患者的生活质量。放射性脑损伤一旦发生，治疗颇为困 难，因此，对接受放疗的鼻咽癌患者进行放射性脑损伤发病风险预测，对高危个体提前采取针对性的保护措施，实现肿瘤的个体化治疗，显得尤为重要。 本发明公开了DISC1FP1基因上的SNP位点rs10501719作为与肿瘤放疗引起的放射性脑损伤发病风险相 关的标志物的应用。同时，制备得到一种预测肿瘤放疗引起的放射性脑损伤发病风险的试剂盒，利用该试 剂盒检测SNP标志物分型，联合患者临床信息可以更加全面准确的评估鼻咽癌患者发生放射性脑损伤的患 病风险。
中山大学
2021-04-10
SARS-CoV-2基因组分析进化和起源的研究
2020年3月8日，安徽师范大学在bioRxiv上上传了一篇题为Genome-widedata inferring the evolution and population demography of the novel pneumonia coronavirus (SARS-CoV-2) 的研究分析，作者使用10个新测序的SARS-CoV-2基因组，并结合GISAID数据库中的136个基因组，通过不同的分析方法（如EBSP、错配和中性检测等）研究前三个月数据的遗传变异和统计。 结果显示80个单倍型共有183个突变位点，包括27个简约性信息位点和156个单一位点。对遗传多样性的滑动窗口分析表明，SARS-CoV-2基因组丰度的变化有一定范围，这可以解释目前这种病毒的广泛和高适应性。遗传学分析不支持穿山甲是中间宿主。在最初的单倍型（H14）中，一个患者样本居住在华南海鲜市场附近（约2公里），这表明患者有无意识接触该市场史的可能性很高。然而，基于这个线索，也无法准确断定这个市场是否是SARS-CoV-2的起源中心。此外，从这个市场收集的16个基因组，包含10个单倍型，表明市场在短期内出现循环感染，这可能导致武汉和其他地区爆发SARS-CoV-2。EBSP结果显示，第一个估计的扩展日期从2019年12月7日开始，这表明SARS-CoV-2的传染可能在11月中下旬开始。
安徽师范大学
2021-04-10
一种小麦抗穗发芽基因TaZFP18及其应用
本发明公开了一种小麦抗穗发芽基因TaZFP18,所述基因包含如SEQ?ID?NO.1所示的核苷酸序列,或包含与SEQ?ID?NO.1序列互补的核苷酸序列,该基因编码CCCH型锌指蛋白18,可作为小麦穗发芽抗感品种的分子标记基因.该小麦抗穗发芽基因TaZFP18为一种新的小麦抗穗发芽主效基因,利用其开发分子标记,可以迅速鉴定小麦是否为穗发芽抗性品种,也为小麦穗发芽抗性育种提供了新的基因资源.
安徽农业大学
2021-04-29
VvSUC27基因在促进植物摄取外界蔗糖中的应用
本发明涉及基因工程技术领域，具体公开了VvSUC27基因(GenBank登录号：AF021810)在促进植物摄取外界蔗糖中的应用以及其在促进植物生长(尤其是在弱光环境或无光环境中生长)中的应用。本发明通过过表达VvSUC27基因，促进了植物摄取外界蔗糖，同时可使转基因植物出现快速生长的表型，并且可以在微光甚至使无光下快速生长，证实了该基因的一个新的功能应用。VvSUC27基因的克隆和转基因的应用，有望应用于肉质根或块根植物及花卉等植物的培育中，使得植物即使在无光下也能快速生长，有利于节约光能减少能源的浪费。
中国农业大学
2021-04-11
预测重型肝炎病情基因的甲基化检测方法及试剂
本发明涉及预测重型肝炎病情基因的甲基化状态检测的方法及试剂，提取病人外周血单个核细胞 DNA 进行亚硫酸氢盐修饰后，分别用谷胱甘 肽 S-转移酶 M3 甲基化（M）特异性和非甲基化（U）特异性引物对进行甲基化 特异性聚合酶链式反应，根据扩增产物判断其甲基化状态，有助于临床医生判 定重型肝炎患者的病情和指导治疗。
山东大学
2021-04-13
创制转基因技术中带有安全筛选标记的安全转化载体
选择标记转基因作物已成为近年来植物基因工程技术研究的重 点之一，随着转基因作物产品的商品化，转基因植物的生物安全性受 到公众越来越多的关注，尤其是目前抗生素标记基因在植物遗传转化 过程中的广泛应用，使人们对这些标记基因可能带来的潜在危害性心 存疑虑，抗性标记基因的存在严重地阻碍了转基因植物的商品化进程 和转化技术本身的有效性。 本项目培育的无抗生素标记基因（可视化标记基因）在建立高效、 安全、规模化的转基因作物技术体系方面取得突破，以紫色幼芽作为 沙 门 屎 肠 副溶血弧 霍 乱 小 肠 结 肠 亲水气单 粪 肠 金 黄 色 肺炎克雷 钩端螺 嗜 肺 军 志 贺 绿 脓可视筛选标记代替抗生素筛选标记，构建了新型转化载体并应用于作 物，已申请 2 项发明专利。
南开大学
2021-04-13
基因转录延伸复合体形成及作用机制的研究
近日，东南大学生命科学与技术学院“发育与疾病相关基因”教育部重点实验室林承棋和罗卓娟课题组在国际顶级期刊《Science Advances》杂志发表了题为ENL initiates multivalent phase separation of the Super Elongation Complex (SEC) in controlling rapid transcriptional activation的文章，阐明了有关基因转录延伸复合体形成及作用机制的研究工作成果。东南大学研究团队的研究揭示了SEC介导的多价相分离在RNA聚合酶II转录暂停释放中起着关键作用，并从全新的角度为基因快速协调性转录激活程序的机制探索提供了新的认识。
东南大学
2021-04-11
口蹄疫与伪狂犬病二价基因工程疫苗
研发阶段/n口蹄疫（FMD）是引起的人及偶蹄动物共患的一种烈急性、高度接触性、发热性传染病。FMD在世界上许多国家流行，造成重大的经济损失和政治影响。口蹄疫病毒（FMDV）属于小RNA病毒科（Picornaviridae），口蹄疫病毒属（Aphthovirus），该病毒为单股正链小RNA病毒，基因组长约8500个核苷酸，主要由结构基因（P1区）和非结构基因（P2、P3区）等构成。该发明具体涉及一种新的含有口蹄疫病毒主要免疫原性基因的重组伪狂犬病弱毒疫苗株，该毒株属于猪伪狂犬病毒：Pseudorabi
华中农业大学
2021-01-12