SARS-CoV-2与SARSr-CoV存在趋同进化的研究

2020年3月5日，东北师范大学在bioRxiv上上传了一篇Strong evolutionary convergence of receptor-binding protein spike between COVID-19 and SARS-related coronaviruses的研究，该研究发现SARS-CoV-2和SARS-CoV存在远缘关系，但两者都能够通过同一受体ACE2感染人类宿主，并引起相似的临床和病理特征，表明S蛋白可能存在趋同进化。然而，其趋同的分子基础仍不得而知。本研究中使用最近开发的分子植物生态学方法来研究趋同的分子基础。分析表明，S蛋白在SARS-CoV-2和SARS-CoV相关分支沿线经历了大量有意义的达尔文选择。进一步研究显示，SARS-CoV-2和SARSr-CoV类之间S蛋白的受体结合域（RBD）中趋同进化的氨基酸位点比例异常高，导致RBD序列在系统发生上的联合。除了S蛋白，作者还发现其伙伴蛋白ORF3a的趋同进化。结果表明，SARS-CoV-2与SARSr-CoV之间具有很强的适应性趋同进化，可能促进它们对类似或相同受体的适应性。最后，作者指出，许多观察到的蝙蝠SARS-like-CoVs与SARS-CoV-2和SARS-CoV的S蛋白的RBD序列存在趋同进化，可能预先适应人类宿主受体ACE2，因此将是潜在的新的冠状病毒来源。