本发明公开了一套早期检测苹果果实内潜伏轮纹病菌的组织学方法,涉及植物组织内病原菌检测领域。本方法适用于调查苹果果实内潜带轮纹病菌的皮孔数量。具体方法为:对于欲检测的苹果果实或果实组织在不低于100℃的温度蒸煮10分钟以上,剥取表皮;剥取的表皮经1%~15%的次氯酸钠透明5~20分钟,1%~30%氢氧化钾或氢氧化钠浸泡3~5分钟,0.1%~3%的苯胺蓝水溶液染色3~5分钟,用20%~80%的甘油作浮