本发明公开了一种抗鱼类淋巴囊肿病毒的单链抗体,以及编码该单链抗体的基因、含有该基因的载体和宿主细胞等。该抗鱼类淋巴囊肿病毒的单链抗体,是由抗体重链可变区和轻链可变区通过接头肽连接而成,并可通过原核表达系统进行高效表达。单链抗体ScFv?ALV的分子量约为28kD,能够特异识别鱼类淋巴囊肿病毒,阻断病毒与天然血清的结合,可进一步用于该病毒的诊断、治疗制剂的开发。