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基于新一代测序的生物信息云平台及其在科研和医疗健康领域的应用
1 项目简介本项目建立的生物云平台,以基于 Web 的方式提供服务,用户可以轻松快速获取服务,国内外普遍缺乏成熟的技术,标准和平台。我们首次把独具特色的机器学习模型预测算法与最新的高通量测序方法( non-polyA RNA-seq) 相结合。我们的研究对象为长链非编码 RNA( non-PolyA),目前国际上还很少有人通过高通量测序技术对疾病的 lncRNA 进行全面预测分析和功能分类。随着测序速度不断提高,测序成本不断降低,本项目将来可以发展为面向人民大众的个性化医疗服务的平台。 图 1 生物医学信息云平台的产业化方向 http://www.incrna.org图 2 生物医学信息云平台的应用程序一览 http://bioinfo.life.tsinghua.edu.cn/serve 本项目使用的核心技术“基于整合性生物信息云计算和新一代测序技术( incRNA) 的非编码基因组疾病(如癌症)检测技术平台”已经通过软件查新认证( 20121022044750914)。正在准备申请国家版权局软件著作权登记证书。2 效益分析( 1)随着新一代高通量测序技术的发展,生物信息数据爆炸式增长,数据解读成为生物医学研究和临床应用的巨大问题,我们团队依托清华大学生命学院鲁志实验室在生物信息学,尤其是在 lncRNA 领域的技术专长开发的云计算平台将为广大科研工作和和临床用户提供可靠的数据分析云服务,提高他们的科研效率,为科学的发展做出贡献。 ( 2)我们团队通过与中国人民解放军总医院,上海肝胆医院等十多家临床单位的合作,将为鉴定癌症的早期诊断和药物治疗提供新的靶点,这不仅会增强中国基础临床科学的发展,通过临床应用还会为病患者带来癌症早期诊断、健康管理等个性化医疗服务,这将具有广泛的社会效益。 ( 3)通过我们打造高通量测序数据分析云计算平台和开展以癌症早期检测为主要内容的个性化医疗服务,将为中国培养一批高水平的生物信息数据分析人才,这将增强中国在生物信息学方面的实力。
清华大学 2021-04-13
数据中心高密插卡式云计算TOR交换机RG-S6920-4C
面向AI等应用发展趋势推出的新一代高性能、高密度插卡式交换机 产品特性: 固化4个扩展插槽,每槽位最大可支持32个100G端口,更好满足数据中心网络演进需求 支持2+2电源与5+1风扇热插拔,支持GR完美重启,实现硬件与链路可靠性双重保护 三层路由功能轻松适配多重业务,数据传输高效有保障 多重管理方式选择 网络维护简单有效 构建下一代数据中心网络 AI/机器学习等应用的高速发展,驱动下一代数据中心网络向100G/400G演进。下一代数据中心网络,要求设备在单位空间内,具备更高的性能、更大的带宽,RG-S6920-4C在4U高度空间内,最大可提供128个100G端口,或64个100G端口+16个400G端口,更好的满足下一代数据中心网络的演进需求。 构建高性能、低延时数据中心网络 RG-S6920-4C交换机配合RG-S6510系列交换机,基于PFC/ECN等网络流控技术,以及MMU调优技术,可构建端到端、无损、低时延转发的RDMA(Remote Direct Memory Access,远程直接内存访问)基础承载网络,满足AI/机器学习、高性能计算、分布式存储大数据等应用场景的网络部署要求。 电信级可靠性保护 RG-S6920-4C交换机支持2+2电源冗余,5+1风扇冗余,所有电源模块以及风扇模块均可以热插拔而不影响设备的正常运行。此外整机还支持电源和风扇的故障检测及告警,可以根据温度的变化自动调节风扇的转速,更好的适应数据中心的环境。还具备设备级和链路级的多重可靠性保护。采用过流保护、过压保护和过热保护技术。 除了设备级可靠性以外,该系列还支持丰富的链路可靠性技术,比如支持GR快速重启、BFD快速转发检测等机制。当网络上承载多业务、大流量的时候,降低异常对网络业务的影响,提升整网可靠性。 IPv4/IPv6双栈协议多层交换 RG-S6920-4C交换机,硬件支持IPv4/IPv6双协议栈多层线速交换,硬件区分和处理IPv4、IPv6协议报文,支持多种Tunnel隧道技术(如手工配置隧道等等),可根据IPv6网络的需求规划和网络现状,提供灵活的IPv6网络间通信方案。 支持丰富的IPv4路由协议,包括静态路由、RIP、OSPF、IS-IS、BGP4等,满足不同网络环境中用户选择合适的路由协议灵活组建网络。 支持丰富的IPv6路由协议,包括静态路由、RIPng、OSPFv3、BGP4+等,不论是在升级现有网络至IPv6网络,还是新建IPv6网络,都可灵活选择合适的路由协议组建网络。 完善的管理性 支持丰富的管理接口,例如Console、MGMT口、USB口,支持SNMPv1/v2/v3,支持通用网管平台。支持CLI命令行, Telnet,集群管理,使设备管理更方便,并且支持SSH2.0、SSL等加密方式,使得管理更加安全。 支持SPAN/RSPAN镜像和多个镜像观察端口,可以将网络流量输出分析以采取相应管理维护措施,使原本不可见的网络业务应用流量变得一目了然,可以为用户提供多种网络流量分析报表,帮助用户及时优化网络结构,调整资源部署。
锐捷网络股份有限公司 2022-09-19
RFID阅读器部署系统
随着RFID技术的进一步发展,RFID系统的大规模应用将成为一种趋势,在未来的应用中将会面临一些重大难题。大规模应用的某些应用场景中,要求RFID读写器的射频信号能够覆盖一个庞大的区域,但由于读写器与标签之间有限的通信距离,这就需要大量的RFID读写器以一种密集的形式部署在整个区域中。目前关于这一问题的研究还非常稀少,这一问题如果没能有效解决,将成为制约RFID系统大规模应用的瓶颈。在RFID大规模部署应用中,有效地进行RFID网络规划,合理放置读写器位置、适当配置读写器参数,使网络资源得到优化分配,在保证高读取率和网络负载平衡的前提下,减少读写器冲突、标签冲突,决定RFID系统服务质量的关键问题。对RFID读写器进行合理有效的部署,不仅从成本上节约不必要的RFID设备投入,提高经济效益;而且通过RFID读写器网络中各个读写器协调工作,能够更加有效的采集RFID标签上的数据,提高RFID系统的整体性能。 RFID阅读器部署系统是以在指定的地图覆盖区域满足一定的覆盖率的情况下如何部署RFID阅读器为研究目标,开发出了一套能根据已指定的地图得到RFID阅读器部署最佳方案的部署软件。通过指定地图编辑相应的地图覆盖区域,然后根据RFID阅读器模型在指定覆盖率的情况下得到最佳的RFID阅读器部署方案。在此基础上也可以指定若干RFID阅读器的部署位置进行重新部署。该部署系统主要包括编辑地图覆盖区域、导入地图覆盖区域、导入读写器模型和部署结果展示四个子模块,主要功能如下: 1. 地图编辑覆盖区域打开地图,编辑地图覆盖区域并保存。其中编辑功能包括图形要素的添加、删除、修改以及图形信息的合成、分解、提取等功能;保存功能主要是通过jpg文件格式、存取、旋转、压缩等算法将地图文件保存为jpg文件格式。 2. 设置地图导入精度,导入地图需要覆盖的区域。地图精度就是地图的精确度,即地图的误差大小,是衡量地图质量的重要标志之一,它与地图投影、比例尺有关。用户可以根据屏幕分辨率、经纬度、地图放大级别以及维度值等,设置地图的导入精度,然后导入需要覆盖的区域。 3. 设置阅读器覆盖区域的导入精度,导入阅读器覆盖区域模型。覆盖区域模型可以是二维的,也可以是三维的。关于覆盖模型的分类有很多,常见的感知模型有以下两种:一种是二元感知模型,另一种是概率感知模型。 4. 根据已经导入的地图需要覆盖的区域和阅读器覆盖区域的模型,在指定覆盖率的前提下,运用粒子群优化算法得出RFID阅读器个数并给出具体的部署坐标,在地图覆盖区域上展示出来。覆盖率一般定义为所有节点所能覆盖到的区域面积与整个需要覆盖区域面积的比值,是衡量无线传感器网络、RFID网络及其它无线网络覆盖性能的重要指标之一。
电子科技大学 2021-04-10
多功能数据采集器
数据采集(DAQ),是指从传感器和其它待测设备等模拟和数字被测单元中自动采集非电量或者电量信号,送到上位机中进行分析、处理。数据采集器是结合基于计算机或者其他专用测试平台的测量软硬件产品来实现灵活的、用户自定义的测量系统。本项目所设计的多功能数据采集器具有8路24bit的A/D转换接口、2路SPI总线、1路I2C总线和6路GPIO,能适应于高精度数据采集的需要。提供多种通信接口,包括CAN、USB、RS232和TCP/IP等,保证其与上位机和其他各种工业、商业设备的实时通信。主控芯片采用ADI公司的Blackfin系列DSP处理器进行数据接收和预处理,保证了数据的准确性、实时性和系统的可靠性。为了方便用户进行二次开发,该数据采集器提供了+12V、+5V、+3.3V等多种电源接口,结合所提供的8路A/D转换接口、2路SPI总线、1路I2C总线和6路GPIO,用户可以方便地外挂各种传感器模块。基于丰富的通讯接口,用户亦容易开发上位机应用软件或控制装置,进而达到快速设计出自己的产品的目的。已申请国家发明专利?项:《一种基于CAN总线的在线故障检测系统》 公开号:10145852
华东理工大学 2021-04-11
MEMS压力传感器
自然频率 55kHz-79 kHz 量程 Normal:9kPa-120kPa Extended:5kPa-160kPa 灵敏度 50-80Hz/kPa 一个大气压下(101.3kPa)的谐振频率 63 kHz-75 kHz 受温度的影响 15V 1.5V 驱动电压 50-80Hz/kPa
电子科技大学 2021-04-10
多功能射流清管器
本发明涉及一种输油管道清管器,尤其是一种多功能射流清管器,其包括同轴线安装的推进装置、检测装置与射流除垢装置,所述推进装置的主体为推进腔,包括大口径的输入腔、口径逐渐变小的锥状腔以及小口径的输出腔,所述检测装置包括流体腔和由无损检测探头、位移传感器和数据存储器组成的检测模块构成,所述射流除垢装置包括呈喇叭状的射流腔体与射流喷嘴。本发明利用高压射流除垢原理,除垢效率高,同时可进行除垢效果检测和管壁缺陷检测,使得管道清洗作业与检测作业合二为一,作业效率高。
浙江大学 2021-04-11
TUR 手术标本收集称重器
相关专利提出是专为经尿道电切手术设计的一款手术中收集标本的装置。采用硬质医用塑料制成,适用于泌尿外科经尿道电切膀胱、前列腺、输尿管碎石手术中标本的收集。
天津医科大学 2021-02-01
纯电动整车控制器
1.概述 纯电动整车控制器主要包括控制器硬件和软件,其中软件包括基础软件与应用软件。应用软件决定了车辆驾驶体验,是各大厂商自主研发的核心知识产权,控制器硬件和基础软件是保证应用软件良好运行的平台。为了解决研发与产品化的问题,我们自主研发形成了快速ECU整套软硬开发解决方案,可实现产品的快速开发。 功能1:整车控制器的主要功能——整车能量协调控制、整车附件控制、整车故障诊断与处理和车辆状态监视与控制等。 功能2:整车数据上传——通过VCU板上嵌入的4G模块,实现整车数据直接上传至平台。 功能3:快速控制器原型——提供完整工具链组合,支持客户二次开发,搭建自己的整车控制逻辑,实现产品快速开发。 2.产品优势 (1)车规级三核32位芯片,频率达200M,具有丰富外设; (2)车规级LTE通信模块(4G模块),专用于车联网领域; (3)芯片CAN模块支持CAN和CANFD两种模式; (4)提供完整工具链组合,支持客户二次开发。 3.应用领域 混合动力/纯电动汽车整车控制器HCU/VCU、电机控制器MCU、电池管理系统BMS、自动变速器TCU、LPG/CNG/LNG发动机ECU等。 4.成功案例 已完成国家重点项目“分布式纯电动轿车底盘及整车产业化研发”中对整车控制器的考核指标,即采用高性能控制芯片作为线控底盘的控制器、整车联网通讯功能及以太网通讯等功能。目前,整车控制器已在多台实车上进行了测试,验证了其功能。 5.可承接项目 (150)-就纯电动整车控制器亲签订开发合作协议(高端装备)
北京理工大学 2021-05-11
散热器在线检测装置
散热器在线检测装置其目的在于克服现有技术中,气泡泄漏检测法需要配置一个完全淹没被测物体的大容器,以及水对被测物体造成腐蚀的缺点,和压力衰减法由于压差很小,对检测设备要求高,以及检测效率低的的缺点。本检测装置是利用二氧化碳作为跟踪气体对容器的各个部分均能敏感反应的原理,设计一种散热器在线检测装置,当腔体内C02的浓度高于空气中C02的浓度则系统报警,从而实现散热器合格性检查的目的。 散热器在线检测装置,包括支撑架、皮带输送机、密闭检测工作室,其特征在于:密闭检测工作室设在支撑架之上,皮带输送机穿入整个密闭工作室,密闭工作室的顶部设置有上部密封片,密闭工作室的四壁连接密闭橡胶帘,与上部密封片构成密闭腔室,上部密封片上搁置工控机,与工控机连接的探头和C02传感器设置在皮带输送机运动方向的末端,且深入到密闭工作室内。 所述皮带输送机的进口与出口处的橡胶帘设置为自由下垂,以方便被检测工件的进、出。 所述工控机上设置有报警装置。本检测装置与现有技术相比具有如下优点: 1.C02作为跟踪气体可有有效降低运行成本。 2.检测精确度高于任何一种现有检测方法。 3.不间断连续检测,效率很高。 4.装置结构简单,运行费用低。
上海理工大学 2021-04-11
撞击流气液反应器
气液反应或化学吸收是化学和石油化学工业中广泛涉及的单元过程。根据物系特性不同,主要是液相化学反应的特性,例如快速、中速、慢速,以及可逆、不可逆等性质不同,各种气液反应或化学吸收过程的性质有很大的差异。已有的用于化学吸收过程的设备有很多种,例如填料塔、鼓泡塔、筛板塔、喷射塔等等,它们各适用于不同的反应体系。已有的用于液相进行快速反应的化学吸收设备主要有喷雾塔、喷射吸收器等。它们分别存在效率不高、设备庞大或动力消耗大的缺点。主要问题在于相间传递系数不够高,使总过程受到传递的限制。本实用新型的目的是克服上述现有技术的不足,利用撞击流显著强化相间传递的特性,提供一种结构简单、紧凑,投资小,操作维修方便,又节省动力的气液反应技术装备。本实用新型撞击流气液反应器采用水平同轴两流撞击流。它由下述三组部件组成:吸收室,加速管和压力雾化喷嘴。吸收室是中部为直筒形,上、下各为锥形顶盖和底的中空筒体;上锥形顶盖上面连接排气管,下锥形底下面连接排液管;直筒内部靠近上锥形顶盖处安装除沫挡板。吸收室中部直筒体的横截面可以做成圆形,也可以制成方形或长方形。加速管有两根,直径和长度相同,它们同轴对称地分别安装在吸收室直筒体中部两侧。压力雾化喷嘴安装在加速管内,喷液方向朝向吸收室中心,并带有进液接管。喷嘴可以对称地安装在两根加速管内,也可以只在一根加速管内安装;使用喷嘴个数根据加速管直径和处理液体或悬浮体量确定。压力雾化喷嘴可以采用普通压力雾化喷嘴,也称离心压力喷嘴;最好采用本实用新型设计人的专利旋涡压力喷嘴(专利号ZL00 2 30305.1)。后者旋流效率更高,因而雾化能耗更低。撞击流气液反应器连续操作。工作时,工艺气体分成两股,以基本相同的流量分别高速流动通过两根加速管;工艺液体或液固悬浮体则由压力雾化喷嘴喷雾成微滴状进入加速管。气体加速雾化微滴并携带它们射出加速管进入撞击流吸收室空腔,在两加速管轴线中心处相向撞击,形成高度湍动和强化传质的撞击区,并在其中完成气液反应或化学吸收作业。反应或吸收后,绝大部分液体或液固悬浮微滴依靠重力下落至吸收室锥形底,经排液管放出,送至后工序处理。为使装置内气体与大气隔绝,排液管下游可设置液封机构;分离绝大部分液体或悬浮体微滴后的气体向上流动,在除沫挡板处折流以进一步脱除雾、沫,随后通过排气管排出。根据工艺安排,排出气体或送去进一步处理,或放空。与现有的气液相反应或化学吸收技术装备相比,本实用新型撞击流气液反应器具有下述显著优点:(1)利用了撞击流强化相间传递的特点,使得液相快速反应不受气膜扩散限制,宏观气液反应或化学吸收过程能高强度地进行,实现小设备大生产;(2)采用压力雾化喷嘴分散工艺液体或液固悬浮体,能量效率高、节能;(3)装置中内部构件少,机械结构简单,设备投资省;(4)由于内部构件少,便于清洗,更能适应反应过程中有固体产物生成的场合。
武汉工程大学 2021-04-11
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