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一种新的探针制备方法
01. 成果简介 荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)是一种以荧光标记取代同位素标记而形成的新的原位杂交方法。其通过杂交探针序列及其荧光,能提供标记位点在细胞核内的空间位置信息,与基于染色质构象捕获(Chromatin Conformation Capture,3C)等各种生物技术(如4C,5C,HiC,ChIA-PET等)互补,成为研究染色质结构不可或缺的重要技术之一。 传统的荧光原位杂交技术一般以含有目标物种来源的一段完整基因组片段作为模板,通过生物酶的作用进行片段化,之后进行荧光标记做出杂交探针,再固定细胞中,通过碱基互补配对原理对特定的基因组片段进行荧光标记并成像,获得具体的核内空间信息。但是,传统的原位杂交技术受限于模板本身的特性,具有准备时间长、所需模板量大、基因分辨率低、克隆中含有重复片段、需要加入物种特异的Cot-1DNA等缺点。尤其是其分辨率低的特点(分辨率在百kb的数量级),让它在应用中受到了很大的限制。 本项成果提供了一种新的针对目标核酸靶标探针的制备方法(见图1),该方法比传统的FISH技术的分辨率提高了1-2个数量级(见图2),可应用于传统荧光原位杂交因分辨率不够而不能探测、或者被错误探测的地方。该成果的具体步骤(见图1)包括:(1)获取感兴趣的靶DNA序列;(2)使用转座酶将靶DNA序列进行片段化的同时,在片段化的DNA序列两端加上接头序列;和(3)利用所述接头序列,获取所述片段化的DNA序列,以产生探针。本项成果的技术优势在于:快速高效、模板需求量低、基因组分辨率高、且不需要Cot-1DNA。 图1 探针制备方法的具体步骤。 02.应用前景 本项成果是一种快速高效、模板需求量低、基因组分辨率高、且不需要Cot-1DNA的荧光原位杂交方法,可作为现有的传统荧光原位杂交技术的可选替代方案。尤其是该方法的分辨率高,比传统的FISH技术的分辨率高1-2个数量级(见图2),因此可应用于传统荧光原位杂交因分辨率不够而不能探测、或者被错误探测的很多地方。 例如,在基因组的三维结构中,TAD(拓扑结构域)是结构和功能的基本单元。TAD内部和TAD之间的增强子和启动子发生的错误的相互作用,是一些癌症发生的根本原因。而传统的FISH技术因为分辨率的限制,探测不到这些错误的相互作用。因此本项成果在临床有着广泛的应用,可以用于癌症及一些其它疾病的极早期检测。 图2  相比于传统的BAC FISH(图上方绿条,长度为152kb),仅用1.170 kb(红条)长的TN5探针,就可以得到要标记的基因组位点的图像。 图中细胞核(蓝色)中,红色和绿色的点相互重叠,说明Tn5 FISH可以用传统的BAC FISH进行验证。黄色箭头表示用Tn5 FISH(红色通道,左上角插入图)或BAC- FISH(绿色通道,左下角插入图)进行成像。图中比例尺为5μm。03. 知识产权 本项成果已申请1项国内发明专利,目前正在申请国际专利。04. 团队介绍 本项目团队负责人为清华大学教授、博士生导师,国家首批千人。团队的主要研究方向涉及:生物信息学和基因组三维结构新方法的开发,利用细胞超分辨率成像、分子成像和生物信息学的方法进行基因组三维结构和系统生物学的研究选。团队负责人曾多次主持或参与美国NIH的R01科研项目、中国国家自然科学基金及科技部的科研项目,已发表高水平学术论文200余篇。05. 合作方式 专利许可、合作开发。06. 联系方式 邮箱:zhangxinrui@tsinghua.edu.cn
清华大学 2021-04-13
高频复合超声扫描探针显微镜
本项目在国家重大科学仪器专项项目支持下,经过4年产学研用相结合技术攻关,成功研制了能表征样品形貌与内部纳米级结构的新型扫描探针显微镜,并实现了产业化。 研制了高稳定度激光器、高灵敏度光学检测器、高Q值扫描探针等核心关键部件,突破了基于ARM+DSP的自适应随机共振微弱信号检测方法、基于脉冲发送皮层模型多频超声图像融合方法以及基于非下采样剪切波变换的局部方差融合方法等核心关键技术,建立了RBG 彩色图像融合模型,成功研制了能表征样品形貌与内部纳米级结构的新型扫描探针显微镜。同时,通过在航天、医学、生物材料、电子器件等领域的实际使用,进一步改进与完善,提高了仪器的可靠性、有效性和实用性。 图1 成果展示 【技术优势】 在内部超声图像分辨率、最大可检测样品厚度等指标方面达到了国际领先水平。 【技术指标】 与国内外同类仪器比较,总体技术指标到达了国际先进水平,部分指标达到了国际领先水平。经过具有国家仪器检测资质的第三方测试结果,各项技术指标见下表: 【资质荣誉】 2021年湖北省科技进步二等奖。
华中科技大学 2023-07-19
原位合成AlN/Al电子封装材料技术
西安科技大学自2007年开始就对电子封装材料制备技术开始研究,目前已经开发出AlN/Al、SiC/Al系列电子封装材料制备技术。涉及原位合成、无压浸渗、热压烧结等多种制备方法。本项成果为一种原位合成AlN/Al电子封装材料技术,目前此项技术已获批国家发明专利1项。
西安科技大学 2021-04-11
一种渗流原位取样器
本专利受到国家科技重大水专项课题《太子河流域山区段河流生态修复与功能提升关键技术与工程示范课题》(编号: 2015ZX07202-012 )的研究支撑,是一种渗流原位取样器,其特征在于包括下列步骤: 1 )取样器由上盖、取样器主体、干簧水位传感器和电子报警装置组成。其中取样器主体由塑料或有机玻璃制成,设计精巧,取材方便。 2 )取样器下段为上段横截面积为上段及上盖面积的二分子一,起到同等流量下放大渗流水位高度的左右,适用于渗流水分较少不利于原位抽取及观测的实际情况。 3 )带刻度木棍测量水位高度,并利用事先计算好的底部面积在取样的同时计算总入渗量,保证取样的精确性。 4 )通过在取样场地内多个取样器的组合应用推断出一定坡长情况下,不同坡面位置的入渗水质及水量情况。
辽宁大学 2021-04-11
残余应力原位高能声束调控系统
残余应力原位高能声束调控系统通过高能声束耦合模式能够实现对任意曲面固体材料内残余应力的进行消减,具有单通道和多通道阵列消减模式,利用高能弹性波的能量改变残余应力势能场,从而达到消减和调控残余应力集中区域的目的。
北京理工大学 2021-02-01
多功能原位微扭转测试仪
一、项目分类 关键核心技术突破 二、成果简介 微米尺度材料、人工肌肉、微型发动机等已经成为机械制造、生物医疗、航空航天等领域必不可少的部分,对它们的扭转力学性能的表征、致动特性的研究、扭矩的计量等是十分必要的,但是如今面临着缺少可靠的微扭转测量设备的重大难题。本技术针对这一难题,开发了多功能原位微扭转测试仪,将测试装置的分辨率提高nNm量级,使其具有高分辨率、高精度、大量程、高稳定性、高可靠性的特点,适宜在不同环境(如温度、湿度等)下使用,为今后微纳米力学领域的实验研究、人工肌肉的制备等方面提供了技术支撑。
华中科技大学 2022-07-27
量子点荧光探针快速检测生物活性分子
完成人简介:樊君,西北大学教授,西北大学化工学院副院长, 陕西省化工过程实验教学示范中心主任,指导博、硕士生研究方向包括反应工程、碳一化工、纳米材料、分离工程、精细化工产品开发研究等。 成果内容:基于量子点的荧光探针分析对推动即时检测(POCT)技术的发展具有十分重要的意义。本项目以制备功能型纳米荧光探针为主,主要包括量子点荧光探针(QDs)和稀土掺杂上转换纳米颗粒(UCNPs),并利用制备的荧光探针实现了对生物活性分子的定量检测。项目设计了基于荧光共振能量传递(FRET)的QDs荧光探针和基于CuMn双掺杂的ZnS QDs比率荧光探针,分别实现了对生物活性分子多巴胺和叶酸的定量检测(图13),结果表明所制备的探针具有较高的选择性和灵敏度,项目成果将为医学检测和POCT技术提供技术支持。   不同反应时间得到的CdTe量子点在紫外灯下的实物图及其吸收和发射光谱 成果优势: 量子点(quantum dots,QDs)是指颗粒半径小于激子波尔尺寸半径的纳米晶粒,属于三维尺度限域的零维纳米材料,其尺寸一般在10nm以下。QDs有许多显著地光学性质:优良的抗光漂白能力; 较宽的吸收光谱;发射光谱窄;较大的斯托克斯位移(Stokes shif)。 成果成熟度:中试阶段。 转化方式:技术转让等。 市场展望:本项目的研究结果对提高疾病诊治水平,推动医学科技前沿发展,形成经济新增长点,带动大健康产业发展等都将具有十分重要的意义。
西北大学 2021-05-11
量子点荧光探针快速检测生物活性分子
项目成果/简介:完成人简介:樊君,西北大学教授,西北大学化工学院副院长, 陕西省化工过程实验教学示范中心主任,指导博、硕士生研究方向包括反应工程、碳一化工、纳米材料、分离工程、精细化工产品开发研究等。成果内容:基于量子点的荧光探针分析对推动即时检测(POCT)技术
西北大学 2021-01-12
光热探针 -- 半导体离子浓度测试仪
光热探针技术是建立在光声显微镜和激光扫描显微镜基础上,利用调制光反射技术发展起来的一种新型探针技术。利用一束强度调制激光聚焦在样品表面,对半导体样品,入射的光能激发的光生载流子,从而引起表面光反射率变化,用另一束探测光可检测此反射率的变化。由于光生载流子数目直接与注入的离子浓度相关,因此可测定表面注入离子浓度的分布。     近年来,曾利用本仪器
南京大学 2021-04-14
低温恒温器-电学 实验室液氮冷却器
 
北京锦正茂科技有限公司 2022-07-05
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