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无需抗体的酶辅助化学标记N6-甲基腺嘌呤(m6A)测序技术
随着首个RNA修饰N6-甲基腺嘌呤(m6A)的去修饰酶FTO的发现,RNA表观遗传学/表观转录组学开始兴起并成为表观遗传学新的研究热点。m6A作为首个被发现的可逆RNA修饰,广泛存在于mRNA,依赖修饰酶、去修饰酶和结合蛋白发挥调控功能。已发现m6A具有调控mRNA剪接、出核、稳定性和蛋白翻译等功能,可以参与发育、配子发生、细胞重编程、生物节律、疾病等多种生理和病理过程的功能调控。为了更好地研究m6A生物功能和临床病理研究,开发m6A高通量测序技术一直是研究的热点。 现有m6A测序技术主要依赖于m6A抗体富集技术,包括低分辨率的m6A-seq/MeRIP-seq和联用iCLIP或PAR-CLIP技术的高分辨率m6A测序技术miCLIP 或PA-m6A-seq。抗体存在对特定RNA序列或结构的潜在非特异性结合,为了解决抗体方法的种种问题,研究者们做出了各种尝试,近期开发了两类无需抗体的m6A测序技术,一类为利用对特定甲基化序列(m6ACA)敏感的RNA核酸内切酶MazF辅助的测序方法(m6A-REF-seq or MAZTER-seq),此类方法只能检测16~25%的m6A位点;另一种是在细胞内表达融合m6A-binding domain(YTH)与胞嘧啶脱氨酶(APOBEC1)的融合蛋白实现的m6A测序(DART-seq),但该方法依赖于细胞转染效率且受限于体外样品的使用。 贾桂芳课题组一直致力于开发和利用核酸化学生物学技术研究RNA化学修饰在动植物中的生物功能研究。在本课题中,贾桂芳课题组巧妙地利用m6A的去甲基酶FTO蛋白作为催化剂,将mRNA上化学惰性的m6A转化为高反应活性的中间态产物N6-羟甲基腺嘌呤(hm6A),然后利用二硫苏糖醇(DTT)的巯基与hm6A发生亚胺1,2加成反应,将不稳定的hm6A转化为更稳定的巯基加成产物dm6A。dm6A上的自由巯基可以与甲烷硫代磺酸(methanethiosulfonate,MTSEA)快速反应,实现在mRNA上m6A的位置标记生物素Biotin,最终可被链霉亲和素珠捕获,从而富集含有m6A修饰的RNA片段供后续高通量测序使用。
北京大学 2021-04-11
专家报告荟萃㊳ | 超星指针集团副总经理王丽洁:AI能力中心助力高校新质生产力发展
在此背景下,我们要直面挑战、狠抓机遇,深化人工智能技术与高校管理的有机融合,加速推进智能管理服务的跃升,有力支撑和保障学校各项业务的高质量、可持续发展。
中国高等教育博览会 2025-03-04
精彩活动预告② | 第63届高博会“营火新话局—AI+教育X”,与校企大咖共话教育未来
延续前两届高博会品牌活动“营火新话局”,本届“营火新话局”全新升级,除了有各行各业专家、大咖们的精彩分享,还将有一场精彩的圆桌对话为大家带来独到观点,现场观众可以随时加入,与演讲嘉宾进行互动交流,开启一场跨界交融的思想盛宴。
高等教育博览会 2025-05-19
国新办举行新闻发布会介绍“十四五”时期知识产权强国建设新进展新成效
“十四五”时期,知识产权事业实现稳中求进、高质量发展,多项指标提前完成,知识产权强国建设迈出坚实步伐,取得一系列新进展新成效。
国新网 2025-07-18
新型冠状病毒基因组注释数据库
2020年1月30日,天津大学生物信息中心新型冠状病毒基因组注释数据库上线,并纳入中国国家基因组科学数据中心向全球开放服务。天津大学生物信息中心的高峰教授、罗昊博士采用已研发的ZCURVE_CoV系列软件对包括新型冠状病毒(2019-nCoV)在内的两千余株冠状病毒的基因组进行了基因识别和酶切位点预测,并以数据库(ZCURVE_CoV Database)的形式提供网上服务。
天津大学 2021-04-10
新型冠状病毒感染肺三维重建
目前,新型冠状病毒疫情肆虐,牵动着全国人民的心。2020年2月21日,北京科技大学计算机与通信工程学院与解放军总医院第五医学中心(302医院)经历多天合作,实现了从新型冠状病毒肺炎患者的CT影像中,进行新型冠状病毒感染肺的数字三维重建工作,为新型冠状病毒诊断和治疗提供数字模型和量化分析依据,对奋战一线的医疗人员和后勤的科研团队提供理论指导。
北京科技大学 2021-04-10
新型冠状病毒实时荧光RT-PCR试剂盒
新型冠状病毒实时荧光RT-PCR试剂盒由华南理工大学中新国际联合研究院孵化企业、广州英赞生物科技有限公司研发。他们生产的用于病毒检测的酶制剂具有特异性强、速度快、检测准的优点。 该酶制剂可以检测到样品中个位数的病毒拷贝,确保检测时不会出现“漏网之鱼”。同时,他们从酶制剂性能和反应体系设计多角度提高试剂盒特异性,防止出现假阳性结果,提高检测准确性。在减少检测时间上,除了进一步提高酶制剂的性能外,他们还将所有试剂预先分装到单个标准PCR反应管,使用时只需添加待检样品即可上机检测,简化了检测操作。 新型冠状病毒实时荧光RT-PCR试剂盒
华南理工大学 2021-04-10
可预防冠状病毒感染作用的候选分子研究
南开大学药学院与天津大学国际生物医药联合研究院组建新药开发联合攻关团队,针对新型冠状病毒的生物学特点、传播特征和公共卫生风险防控的潜在需求,开展了病毒防治相关药物的研发,从药食同源分子中发现了可预防冠状病毒感染作用的候选分子。 南开大学药学院与研究院联合攻关团队,利用人工智能辅助的虚拟药物筛选系统,从中药单体库、药食同源天然分子库和成药化合物库中筛选潜在的互作界面抑制剂,尤其关注药食同源类物质所含的活性分子。通过筛选和既往药理信息的综合分析,观察到多种药食同源的中药中含有抑制病毒与受体结合的潜在活性分子,为中医药方剂的配伍和新型冠状病毒感染的肺炎的防治提供了一定的信息。
南开大学 2021-04-10
温室白粉虱在分离番茄褪绿病毒中的方法
本发明涉及温室白粉虱在分离番茄褪绿病毒的应用,包括如下步骤:(1)将温室白粉虱用被番茄黄化曲叶病毒和番茄褪绿病毒侵染的番茄病株饲喂,制得染毒温室白粉虱;(2)用染毒温室白粉虱侵染番茄健康植株,制得感染番茄褪绿病毒的番茄植株。本发明首次发现温室白粉虱具有只传播番茄褪绿病毒而不传播番茄黄化曲叶病毒的特点,从而利用上述特点高效批量进行ToCV单一毒株的建立,不仅可以保证病毒分离的可靠稳定性,而且利用媒介
青岛农业大学 2021-01-12
基于黑猩猩型腺病毒载体的埃博拉疫苗研发
已有样品/n成功构建了新型黑猩猩型腺病毒AdC68和AdC7作为疫苗载体,以此为基础,分别研制了两种新型的埃博拉疫苗,即AdC68-EBOVgp、AdC7-EBOVgp,并在小鼠、非人灵长类动物中都验证其免疫原性及保护性效果。对于埃博拉疫情的控制,目前尚无有效手段,以黑猩猩型腺病毒为载体的新型埃博拉疫苗的研发成功不仅将满足患者的需求,而且将解决这一重大的公共卫生问题,产生巨大的经济效益和重大的社会价值。
中国科学院大学 2021-01-12
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