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人工智能药物筛选、药物设计及毒性预测算法
本成果采用最新的深度学习和分子模拟算法,结合新一代分子特征化方法,开发了多种计算机模型,可用于药物开发中的多个阶段,为药物的快速设计开发提供一个完整的基于人工智能的解决方案。成果:1.药物毒性预测方法:传统的化合物毒性检测技术一般需要使用生化试验、细胞实验、甚至动物模型,这些方法不仅耗费大量时间,而且成本很高。使用计算模型进行有机化合物的毒性预测,所需投入较少,但产出巨大。特别是基于化合物的物理化学和结构特性的计算模型,甚至能够在化合物合成之前就对其进行预测,大大提高了效率,使其越来越受到欢迎。在进行体外和体内试验之前先使用计算机模型对化合物进行大规模的毒性筛选,能够更好地解决候选药物具有毒性的问题。我们建立了一套新的基于多种分子指纹和机器学习算法的化合物毒性预测集成学习算法,运用此集成学习算法建立了新的有机化合物致癌性、致突变性和肝毒性预测模型。我们分别建立了名为CarcinoPred-EL (http://112.126.70.33/toxicity/CarcinoPred-EL/, 致癌性预测)、MutagenPred-EL (http://112.126.70.33/toxicity/MutagenPred-EL/, 致突变性预测)、LiverToxPred-EL (http://112.126.70.33/toxicity/LiverToxPred-EL/, 肝毒性预测)的预测服务器,这些服务器能够为使用者提供更高效更便捷的预测技术服务。自2017年服务器发表起,我们已为国内外药物分子设计研究者提供了5000多次共计超过20多万个化合物的毒性预测服务。在有机化合物毒性预测研究方向,我们主要完成了化合物的细胞毒性、心脏毒性、生殖毒性、血脑屏障透过性、水生生物毒性预测模型,以及糖尿病早期筛查模型的开发,正在进行P450酶阻滞剂性预测模型、基于图神经网络的毒性预测算法研究、基于分子对接的化合物毒性预测研究等。相关研究成果已发表多篇学术论文(Zhang L., et al. Scientific Reports, 2017, 7: 2118. WOS被引次数80,ESI 1%高被引论文;Ai H., et al. Toxicological Sciences, 2018, 165: 100-107;Yin Z., et al. Journal of Applied Toxicology. 2019, 39(10): 1366-1377;Ai H., et al. Ecotoxicology and Environmental Safety. 2019, 179: 71-78;Liu M., et al. Toxicology Letters. 2020, 332: 88-96;Feng H., et al. Toxicology Letters. 2021, 340: 4-14;Li S. et al. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences. 2021, 13: 25-33.)致癌性预测服务器首页致癌性预测结果页相关综述对本服务器的介绍RF-hERG-Score预测药物引起的hERG相关心脏毒性2.药物设计方法:在计算机上对药物靶点和药物分子的结构和活性建模,计算药物与靶点之间的相互作用关系,从而设计出具有治疗作用的药物。计算机辅助药物设计可以为药物设计各阶段的实验方案提供有意义的指导,减少需要通过实验评估的候选药物的数量,从而加快新药研发速度。我们应用分子对接、分子动力学模拟、自由能计算、机器学习等方法研究流感病毒等重要疾病的计算机辅助药物设计、并开发更有效的计算机辅助药物设计方法。在计算机辅助药物设计研究我们主要完成了流感病毒M2质子通道蛋白抑制剂虚拟筛选方法研究,正在进行先导化合物生成模型研究、基于机器学习的虚拟筛选打分函数算法开发、SARS-CoV-2病毒S蛋白与受体相互作用及药物设计研究。特异性重打分函数显著虚拟筛选性能显著较高筛选出两个候选抑制剂3.药物靶点识别方法:长非编码RNA(lncRNA)是一种长度在200nt至100,000nt之间的非编码RNA,是转录物的主要成分。研究表明lncRNA在许多生物学和病理学过程中起着重要作用。lncRNA起作用的重要途径是与其靶蛋白结合。lncRNA-蛋白质相互作用的实验研究需要大量资源。累积的实验数据使得通过计算方法预测lncRNA-蛋白质相互作用成为可能。我们使用各种数学建模和机器学习方法开发了几种用于预测lncRNA-蛋白质相互作用的新模型。这些模型命名为:RWLPAP(随机游走),LPI-NRLMF(邻域正则化逻辑矩阵分解),IRWNRLPI(集成随机游走和邻域规则化Logistic矩阵分解),LPI-BNPRA(双向网络投影推荐算法),LPI-ETSLP(基于特征值变换的半监督链路预测),HLPI-Ensemble(集成学习)。在交叉验证中,我们的模型获得了较好的预测性能。lncRNA-蛋白质相互作用预测模型的性能比较lncRNA-蛋白质相互作用预测服务器相关软件著作权:
辽宁大学 2021-04-10
人工智能药物筛选、药物设计及毒性预测算法
本成果采用最新的深度学习和分子模拟算法,结合新一代分子特征化方法,开发了多种计算机模型,可用于药物开发中的多个阶段,为药物的快速设计开发提供一个完整的基于人工智能的解决方案。 成果:1.药物毒性预测方法:传统的化合物毒性检测技术一般需要使用生化试验、细胞实验、甚至动物模型,这些方法不仅耗费大量时间,而且成本很高。使用计算模型进行有机化合物的毒性预测,所需投入较少,但产出巨大。特别是基于化合物的物理化学和结构特性的计算模型,甚至能够在化合物合成之前就对其进行预测,大大提高了效率,使其越来越受到欢迎。在进行体外和体内试验之前先使用计算机模型对化合物进行大规模的毒性筛选,能够更好地解决候选药物具有毒性的问题。我们建立了一套新的基于多种分子指纹和机器学习算法的化合物毒性预测集成学习算法,运用此集成学习算法建立了新的有机化合物致癌性、致突变性和肝毒性预测模型。我们分别建立了名为CarcinoPred-EL (http://112.126.70.33/toxicity/CarcinoPred-EL/, 致癌性预测)、MutagenPred-EL (http://112.126.70.33/toxicity/MutagenPred-EL/, 致突变性预测)、LiverToxPred-EL (http://112.126.70.33/toxicity/LiverToxPred-EL/, 肝毒性预测)的预测服务器,这些服务器能够为使用者提供更高效更便捷的预测技术服务。自2017年服务器发表起,我们已为国内外药物分子设计研究者提供了5000多次共计超过20多万个化合物的毒性预测服务。在有机化合物毒性预测研究方向,我们主要完成了化合物的细胞毒性、心脏毒性、生殖毒性、血脑屏障透过性、水生生物毒性预测模型,以及糖尿病早期筛查模型的开发,正在进行P450酶阻滞剂性预测模型、基于图神经网络的毒性预测算法研究、基于分子对接的化合物毒性预测研究等。相关研究成果已发表多篇学术论文(Zhang L., et al. Scientific Reports, 2017, 7: 2118. WOS被引次数80,ESI 1%高被引论文;Ai H., et al. Toxicological Sciences, 2018, 165: 100-107;Yin Z., et al. Journal of Applied Toxicology. 2019, 39(10): 1366-1377;Ai H., et al. Ecotoxicology and Environmental Safety. 2019, 179: 71-78;Liu M., et al. Toxicology Letters. 2020, 332: 88-96;Feng H., et al. Toxicology Letters. 2021, 340: 4-14;Li S. et al. Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences. 2021, 13: 25-33.) 致癌性预测服务器首页 致癌性预测结果页 相关综述对本服务器的介绍 RF-hERG-Score预测药物引起的hERG相关心脏毒性 2.药物设计方法:在计算机上对药物靶点和药物分子的结构和活性建模,计算药物与靶点之间的相互作用关系,从而设计出具有治疗作用的药物。计算机辅助药物设计可以为药物设计各阶段的实验方案提供有意义的指导,减少需要通过实验评估的候选药物的数量,从而加快新药研发速度。我们应用分子对接、分子动力学模拟、自由能计算、机器学习等方法研究流感病毒等重要疾病的计算机辅助药物设计、并开发更有效的计算机辅助药物设计方法。在计算机辅助药物设计研究我们主要完成了流感病毒M2质子通道蛋白抑制剂虚拟筛选方法研究,正在进行先导化合物生成模型研究、基于机器学习的虚拟筛选打分函数算法开发、SARS-CoV-2病毒S蛋白与受体相互作用及药物设计研究。 特异性重打分函数显著虚拟筛选性能显著较高 筛选出两个候选抑制剂 3.药物靶点识别方法:长非编码RNA(lncRNA)是一种长度在200nt至100,000nt之间的非编码RNA,是转录物的主要成分。研究表明lncRNA在许多生物学和病理学过程中起着重要作用。lncRNA起作用的重要途径是与其靶蛋白结合。lncRNA-蛋白质相互作用的实验研究需要大量资源。累积的实验数据使得通过计算方法预测lncRNA-蛋白质相互作用成为可能。我们使用各种数学建模和机器学习方法开发了几种用于预测lncRNA-蛋白质相互作用的新模型。这些模型命名为:RWLPAP(随机游走),LPI-NRLMF(邻域正则化逻辑矩阵分解),IRWNRLPI(集成随机游走和邻域规则化Logistic矩阵分解),LPI-BNPRA(双向网络投影推荐算法),LPI-ETSLP(基于特征值变换的半监督链路预测),HLPI-Ensemble(集成学习)。在交叉验证中,我们的模型获得了较好的预测性能。 lncRNA-蛋白质相互作用预测模型的性能比较 lncRNA-蛋白质相互作用预测服务器相关软件著作权:
辽宁大学 2021-05-10
RealSafe人工智能安全平台
业界首个针对AI在极端和对抗环境下的算法安全性检测与加固的工具平台“对抗样本”成新型病毒,算法安全问题亟待解决随着人工智能技术的高速发展,人工智能在诸多场景正逐渐替代或协作着人类的各种劳动,它们可以成为人类的眼睛、耳朵、手臂甚至大脑。其中,机器视觉作为AI时代的基础技术,其背后的AI算法一直是各科技巨头和创业公司共同追逐的热点。然而在机器视觉诸多主流应用场景的背后,往往也藏着由技术性缺陷导致的算法安全风险。例如,在一些训练数据无法覆盖到的极端场景中,自动驾驶汽车的识别系统可能出现匪夷所思的决策,危害乘车人的人身安全。从2016年至今,Tesla、Uber等企业的辅助驾驶和自动驾驶系统就都曾出现过类似致人死亡的严重事故。并且这类极端情形也可能被恶意制造并利用,发动“对抗样本攻击”,去年7月,百度等研究机构就曾经通过3D技术打印出能让自动驾驶“无视”的障碍物,让车辆面临撞击风险。而以上攻击之所以能成功,主要是机器视觉和人类视觉有着很大的差异。因此可以通过在图像、物体等输入信息上添加微小的扰动改变(即上述故意干扰的“对抗样本”),就能导致很大的算法误差。此外,随着AI的进一步发展,AI算法模型将运用金融决策、医疗诊断等关键核心场景,这类AI“漏洞”的威胁将愈发凸显出来。近年来,包括清华大学人工智能研究院院长张钹院士、前微软全球执行副总裁沈向洋等均提倡要发展安全、可靠、可信的人工智能以及负责任的人工智能,其中AI的安全应用均是重点方向。而且,AI安全作为新兴领域,在开源社区、工具包的加持下,对抗样本等攻击手段日益变得复杂,相关防御手段的普及和推广却难以跟上。并且对抗样本等算法漏洞检测存在较高的技术壁垒,目前市面上缺乏自动化检测工具,而大部分企业与组织不具备该领域的专业技能来妥善应对日益增长的恶意攻击。从安全测评到防御加固,RealSafe让AI更加安全可控就如网络安全时代,网络攻击的大规模渗透诞生出杀毒软件,RealAI团队希望通过RealSafe平台打造出人工智能时代的“杀毒软件”,帮助企业高效应对人工智能时代下算法漏洞孕育出的“新型病毒”。目前,RealSafe平台主要支持两大功能模块:模型安全测评、防御解决方案。其中,模型安全评测主要为用户提供AI模型安全性评测服务。用户只需接入所需测评模型的SDK或API接口,选择平台内置或者自行上传的数据集,平台将基于多种算法生成对抗样本模拟攻击,并综合在不同算法、迭代次数、扰动量大小的攻击下模型效果的变化,给出模型安全评分及详细的测评报告(如下图)。目前已支持黑盒查询攻击方法与黑盒迁移攻击方法。防御解决方案则是为用户提供模型安全性升级服务,目前RealSafe平台支持五种去除对抗噪声的通用防御方法,可实现对输入数据的自动去噪处理,破坏攻击者恶意添加的对抗噪声。根据上述的模型安全评测结果,用户可自行选择合适的防御方案,一键提升模型安全性。另外防御效果上,根据实测来看,部分第三方的人脸比对API通过使用RealSafe平台的防御方案加固后,安全性可提高40%以上随着模型攻击手段在不断复杂扩张的情况下,RealSafe平台还持续提供广泛且深入的AI防御手段,帮助用户获得实时且自动化的漏洞检测和修复能力。准确度99.99%也难逃被“恶意干扰”,RealSafe高效应对算法威胁 考虑到公众对于对抗样本这一概念可能比较模糊,RealSafe平台特意选取了公众最为熟知的人脸比对场景(人脸比对被广泛用于金融远程开户、刷脸支付、酒店入住登记等场景的身份认证环节)提供在线体验。并且,为了深入研究“对抗样本”对人脸比对系统识别效果的影响,RealAI 团队基于此功能在国内外主流 AI 平台的演示服务中进行了测试。实测证明,“对抗样本”可以极大的干扰人脸比对系统的识别结果,而测试的这几家互联网公司平台开放的人脸比对API或SDK,几乎覆盖了目前市面上很多中小型企业在落地人脸识别应用时的选择,如果他们的人脸比对技术存在明显的安全漏洞,意味着更广泛的应用场景将存在安全隐患。因此,为了帮助更大范围内的企业高效应对算法威胁,RealSafe平台具备以下两大优势:·  组件化、零编码的在线测评:相较于ART、Foolbox等开源工具需要自行部署、编写代码,RealSafe平台采用组件化、零编码的功能设置,免去了重复造轮子的精力与时间消耗,用户只需提供相应的数据即可在线完成评估,学习成本低,无需拥有专业算法能力也可以上手操作。·可视化、可量化的评测结果:为了帮助用户提高对模型安全性的概念,RealSafe平台采用可量化的形式对安全评测结果进行展示,根据模型在对抗样本攻击下的表现进行评分,评分越高则模型安全性越高。此外,RealSafe平台提供安全性变化展示,经过防御处理后的安全评分变化以及模型效果变化一目了然。从数字世界到物理世界 RealAI落地更多安全周边产品随着机器学习模型不断的升级演化,“对抗样本”已经演变成一种新型攻击手段,并且逐渐从数字世界蔓延到物理世界:在路面上粘贴对抗样本贴纸模仿合并条带误导自动驾驶汽车拐进逆行车道、胸前张贴一张对抗样本贴纸在监控设备下实现隐身……因此,除了针对数字世界的算法模型推出安全评测平台,RealAI团队也联合清华大学AI研究院围绕多年来积累的领先世界的研究成果落地了一系列AI攻防安全产品,为更多场景保驾护航。比如通过佩戴带有对抗样本图案的“眼镜”,黑客可以轻易破解商用手机的面部解锁,通过在胸前张贴特制花纹实现在AI监控下的“隐身”,以及通过在车辆上涂装特殊花纹躲避AI对车辆的检测。发现类似新型漏洞的同时,RealAI也推出相应的防御技术,支持对主流AI算法中的安全漏洞进行检测,并提供AI安全防火墙对攻击AI模型的行为进行有效拦截。人工智能的大潮滚滚而来,随之而来的安全风险也将越来越多样化,尤其近年来因AI技术不成熟导致的侵害风险也频频发生,可以说,算法漏洞已逐渐成为继网络安全、数据安全后又一大安全难题。所幸的是,以RealAI为代表的这些顶尖AI团队早已开始了AI安全领域的征程,并开始以标准化的产品助力行业降低应对安全风险的门槛与成本。此次上线RealSafe人工智能安全平台是RealAI的一小步尝试,但对于整个行业而言,这将是人工智能产业迈向健康可控发展之路的一大步。
清华大学 2021-04-10
血管疾病智能介入诊疗平台
心脑血管类疾病是我国居民首要致残致死原因,介入手术已成为其主要治疗手段,但因操作失误或器械植入不当可引发灾难性后果。本项目针对这一重大民生问题开展研究,核心技术包括:1) 基于深度学习的血管疾病医学影像自动分割及三维重建算法,服务于智能诊断;2) 基于生物力学和计算机视觉的虚拟手术算法,服务于术前规划;3) 基于血液动力学的高精度算法,服务于血管疾病功能参数的分析。基于上述技术,本项目构建集合智能诊断、术前规划、术后转归预测及风险评估的诊疗一体化系统,服务于相关疾病的智能临床诊治。
北京理工大学 2023-05-09
血管疾病智能介入诊疗平台
心脑血管类疾病是我国居民首要致残致死原因,介入手术已成为其主要治疗手段,但因操作失误或器械植入不当可引发灾难性后果。本项目针对这一重大民生问题开展研究,核心技术包括:1) 基于深度学习的血管疾病医学影像自动分割及三维重建算法,服务于智能诊断;2) 基于生物力学和计算机视觉的虚拟手术算法,服务于术前规划;3) 基于血液动力学的高精度算法,服务于血管疾病功能参数的分析。基于上述技术,本项目构建集合智能诊断、术前规划、术后转归预测及风险评估的诊疗一体化系统,服务于相关疾病的智能临床诊治。 图1.主动脉夹层智能诊疗系统
北京理工大学 2022-11-04
人工智能教学实验平台
面向人工智能专业方向理论和实验的云教学平台,融合了Jupyter Notebook实验平台和教学资源中心两大模块。提供开箱即用人工智能编码实验环境,使教学过程高效、便捷。
新大陆教育 2022-06-23
智能家居系统集成平台
本项目来源于国家项目,目前已经申请专利。 智能家居是以住宅为平台,利用综合布线技术、网络通信技术、自动控制技术、远程控制技术、音视频技术将家居生活有关的设施集成,构建高效的住宅设施与家庭日程事务的管理系统,提升家居安全性、便利性、舒适性、艺术性,并实现环保节能的居住环境。 本平台由环境感知系统、家电控制系统、信息整合平台和远程控制系统组成。 环境感知系统由无线传感网络和相应的数据接口组成;家电控制系统由家电控制子网管和普通家电组成;信息整合平台由Agent中间件接和集中控制网关组成;远程控制系统由手机、平板和网关组成。平台的主要功能有:1、     环境感知:布置在家庭环境中的温湿度、光照、烟雾、有害气体传感器,利用WSN技术组网,能够实时地采集环境数据,并上传到网管进行分析;2、     家电控制:在数字家庭中布置1到多个物联网智能红外遥控器,通过以太网、RS485、Zigbee等技术连接到网关,通过智能学习家电控制码,完成家电控制的请求;3、     调度:家庭网关系统可以和任何家庭设备对话,随时监测设备的状况(无须打扰用户),这样便于车辆的集群调度;4、     安防预警:烟雾和有害气体传感器能够随时监控室内环境,网关分析监控数据并在必要的时候报警;5、     远程控制与信息推送:手机软件与智能家居网关通过WCF技术相连,利用GSM推送信息,实现远程接听监控和危险报警;6、     系统接入接口:利用WCF技术发布WebService服务,可以满足跨平台的设备接入,同时提供C#语言的设备接入规范SDK;7、     信道安全附加硬件:硬加密信息传输信道,保证传输过程的安全性。
北京科技大学 2021-04-11
智能化居家养老平台
智能化居家养老平台智能化居家养老系统是专为中国特色养老定制的智能化服务体系,以居家为主要养老空间,在家中实现和满足亲情交流和对外沟通可视化、助老需求和家政管理智能化、休闲娱乐便利化、健康管理网络化、医疗资源集约化、资讯服务多元化等全方位居家养老需求。
清华大学 2021-04-13
智能课堂教学智慧纸笔平台
产品详细介绍 对教师:纸笔围绕课堂教学场景,智能批改,增效减负,双向互动,提升学生动能和效能。 智慧纸笔平台以个人电子终端为载体的智慧课堂,开启名校联盟资源共享模式,贯穿预习、上课、作业、辅导、评测等各个学习环节,覆盖课前、课中、课后全过程,支持各种高效学习方式和师生平等互动。 具有区域视图、学校视图、班级视图、学生视图,从多维度记录学生的学习成长轨迹。 1. 传统纸笔书写,保护视力 3. 作业自动批改,减负增效 5. 精准资源推荐、提分提质 对于学生——学习问题诊断更精准;AI辅导更具个性化;伴随式成长数据驱动智能适应学习。 对于家长——指导孩子更科学;辅导孩子更有方向。 对于教师——减轻作业批改负担;教学效果反馈更即时;教学调整更有依据。 对于学校——教育进步可视化;更科学的管理;更明确的教育质量提升方向。 对于教育系统——区域教育质量检测更专业。 联系方式: 地址:广州市黄埔区科学城南翔一路62号3楼宏途教育 电话:176-8839-3738
广州宏途教育网络科技有限公司 2021-08-23
DanaStudio 大数据智能开发平台
DanaStudio 基于 B/S 架构,底层可对接通用的大数据底层平台,经历了多个大数据项目考验,是一款稳定、高性能的技 术服务平台。DanaStudio 作为数据智能工具中台,与底层大数据平台可灵活适配,适配不同数据规模环境,支持 GB 级 别数据量的单机业务数据库场景、TB 级别 MPP 分布式数据库场景,也支持 PB 级别 Hadoop 离线数仓大数据处理场景。 DanaStudio 采用前后端分离架构,后端服务支持微服务化管理,便于运维和管理。
上海德拓信息技术股份有限公司 2022-05-25
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