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西安交大科研人员开发微卫星不稳定性检测新方法,助力肿瘤精准检测
微卫星不稳定性(Microsatellite Instability, 简称MSI)是目前肿瘤临床检测中一种非常重要的分子表型,多发生于结直肠癌、胃癌、和子宫内膜癌。微卫星不稳定性与肿瘤的发生、发展,治疗方案制定及治疗效果预测相关,更是肿瘤免疫治疗疗效预测的重要分子标记物。当前,临床上使用的两种微卫星不稳定性检测的金标准方法:MSI-PCR和MSI-IHC,都需要专业技术人员通过实验操作来完成,均费时费力且成本较高。近年来,随着高通量测序(Next Generation Sequencing)的发展,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方法开始显露头角,在检测结果与两种临床金标准保持高度一致的情况下,极大的缩减了检测时间并减少了检测成本,大幅提高了推广微卫星不稳定性检测的可行性。2014年,西安交大叶凯教授团队率先开发了基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方案——MSIsensor。2017年该检测方案作为全世界首个泛肿瘤检测方案MSK-IMPACT中的微卫星不稳定性计算方法,通过了美国食品药品监督管理局的严格测试并获得批准。美国纪念斯隆凯特琳癌症中心测试表明,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测与金标准的一致性可达99.4%。然而,微卫星不稳定性检测方案大都要求提供病人的癌症组织样本及一份取自血液或者癌症组织附近的正常样本。一方面,这一份正常对照样本限制了微卫星不稳定性的应用场景,尤其难以应用于血癌样本、福尔马林包埋样本、PDX/PDO等不易获得正常对照样本的情况;另一方面,额外的对照样本增加了微卫星不稳定性的检测成本。基于上述原因,在叶凯指导下,叶凯青年科学家工作室科研人员经过两年的探索,从微卫星不稳定性发生机理出发,通过数学模型抽象,从单个肿瘤样本中提取特征,开发了MSIsensor-pro。MSIsensor-pro实现不依赖正常对照样本的微卫星不稳定性检测,只需50个微卫星位点的测序数据即可实现微卫星不稳定性的精准检测。MSIsensor-pro的开发扩大了微卫星不稳定性的应用范围,减低了微卫星不稳定性检测的成本。同时MSIsensor-pro在低肿瘤纯度和低测序深度这类低信噪比数据中也显示出来很大的潜力。 该研究成果近期发表在国际组学和生物信息学领域权威期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》(影响因子6.597)上。叶凯的博士生贾鹏为该论文的第一作者,叶凯为通讯作者,西安交通大学为本文唯一通讯作者单位。这是叶凯教授课题组在基因组暗物质解析方面的又一重要突破。论文链接为:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1672022920300218
西安交通大学 2021-04-10
南京农业大学国家作物种质资源南京观测站质构仪采购项目招标公告
南京农业大学国家作物种质资源南京观测站质构仪采购项目招标项目的潜在投标人应在江苏省南京市雨花台区软件大道109号雨花客厅2幢1307室获取招标文件,并于2022年06月20日09点00分(北京时间)前递交投标文件。
南京农业大学 2022-05-27
壳聚糖新型两亲性聚电解质衍生物合成洗涤消毒剂(产品)
成果简介:甲壳素是从虾蟹等甲壳类动物的外壳以及菌,藻类低等植物的细 胞壁中提取的天然高分子材料,是自然界中的第二大生物衍生资源。壳聚糖 是甲壳素的 N-脱乙醛基产物,是自然界中唯一的阡性多糖。我们在对羧甲基 壳聚糖的制备方法进行深入研究的基础上,对羧甲基壳聚糖的进一步改性进 行深入地研究。制备出了具有表面活性、络合、抗菌、可降解无毒耐盐、廉价等优异性能的高档洗涤剂。可替代进口高档洗涤剂,主要用于果疏的清
北京理工大学 2021-04-14
专家报告荟萃⑤ | 谭建荣院士:新质生产力与智慧城市 关键技术与发展趋势
新质生产力是推动经济高质量发展的重要驱动力。新质生产力可以理解为新一代信息技术牵引的生产力,信息技术不仅改变了人类的生产方式、生活方式、思维方式和学习方式,也对职业教育方式产生了深远影响。
中国高等教育博览会 2024-12-10
专家报告荟萃⑭ | 重庆大学副校长卢义玉:新质生产力赋能创新创业教育
重庆大学将就业视为重中之重,不仅关心学生的就业率,更重视学生能够高质量就业。要实现高质量的就业,就必须要对学生各方面进行培养。
中国高等教育博览会 2025-01-10
专家报告荟萃⑲ | 重庆大学副校长卢义玉:新质生产力赋能创新创业教育
重庆大学将就业视为重中之重,不仅关心学生的就业率,更重视学生能够高质量就业。要实现高质量的就业,就必须要对学生各方面进行培养。怀部长在会议上强调的“三个谱”:知识图谱、能力图谱、素质图谱方面的工作,重庆大学关心的重点是能力图谱的建设和创新能力的培养。
中国高等教育博览会 2025-01-20
应用于 5G/6G 的高性能无线通信器件及自检测设备的研发及产业化
目前市场上缺乏能够成套交付新要求的毫米波天线、集成度高的滤波器等无源器件、以及其相应的检测设备的综合性企业,特别是具有从设计,加工,调试到性能检测认证的全产业链能力。基于我们朗普达创始团队的核心技术,我们不但能够提供业界最领先的毫米波天线模组,高性能的滤波器和其他无源器件产品,还可以交付针对这些器件的测试检测设备。这两方面的产品能力互相补充,互相促进,互相拓展,使得朗普达的产品具有客户群体广泛,客户类型多样,能够快速适应市场变化等特点。 我们的毫米波的人工电磁材料技术可以让5G基站天线具有比4G基站天线更小面积和更多的天线数及接口,极大地提高系统容量和频谱效率;天线阵列宽角扫描技术,可以在不增加天线数目的基础上将手机的覆盖能力提高70%以上;是满足新一代无线通信产业对多天线系统小体积、高容量、广覆盖的需求的重要保障,显得尤为迫切和重要。我们基于矢量拟合法的滤波器特性提取和诊断算法,能够更精准的设计高良率的无源器件;同时结合神经网络和人工智能算法,可以适用于我司的滤波器自动检测设备和产线,实现滤波器的无人调试和高效检验交付。
西安电子科技大学 2022-06-10
一种基于物联网技术的轨道异物入侵自动检测与预警方法
一种基于物联网技术的轨道异物入侵自动检测与预警方法,具体实施步骤如下:A.搭建路面视频监控系统及车载视频监控系统;B.路网实时监控、视频信号无线传输及自适应反馈;C.云端数据、车载数据处理及异物入侵检测、识别与预警;D.全路网信息共享、异物入侵行车控制及相关路网行车调度。
浙江大学 2021-04-11
一种二氧化碳浓度修正的呼出气多组分检测仪
本实用新型公开了一种二氧化碳浓度修正的呼出气多组分检测仪,该检测仪包括过滤瓶、载气气泵、干燥管、进样气泵、样品环、第一两相三通电磁阀、第二两相三通电磁阀、第三两相三通电磁阀、色谱柱和检测气室,连通后分别构成进样通路、清洗通路和检测通路。所述检测气室为长方体结构,开有PCB板槽、MOS传感器槽、二氧化碳传感器槽、测温孔、气体反应室等。传感器可快速给出响应并恢复基线,输出响应经信号处理与计算后,得出氢气、甲烷浓度,并可根据二氧化碳浓度进行修正,降低样本采集限制条件,减少呼气采集等人为因素造成的误差。该仪器功能完善,体积小,操作简便,准确性、稳定性、重复性较高,用户交互友好,有利于大规模临床应用的推广。
浙江大学 2021-04-13
一种适用于高炉瓦斯灰中碳来源的拉曼光谱定量检测方法
本发明提供一种高炉瓦斯灰碳来源的定量检测方法,包括标定·690·和检测步骤;标定步骤为:获取多种不同煤焦质量比例的煤焦样品的拉曼光谱,依据拉曼光谱确定 D 峰与 G 峰强度比 ID/IG,以及 D 峰与G 峰间的波谷最低点 V 与 G 峰强度比 IV/IG,将其作为评价指标,建立样品的煤炭或焦炭占样品中含碳物质的比例与评价指标间的映射关系;检测步骤为:对待测高炉瓦斯灰的拉曼光谱分析,确定 ID/IG 和
华中科技大学 2021-04-14
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