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李天来院士团队许涛课题组在Science子刊发布植物器官脱落分子机制最新研究成果

 三疣梭子蟹基因组图谱     唐伯平供图虾蟹类基因组是公认的高复杂基因组，要获得高质量的基因组有着很多困难。近日，由盐城师范学院江苏省盐土生物资源研究重点实验室教授唐伯平课题组牵头的中外合作团队，第一次获得了我国重要淡水和海水经济蟹类中华绒螯蟹和三疣梭子蟹的高质量基因组图谱，并分别在线发表于GigaScience和《遗传学前沿》。三疣梭子蟹（Portunus trituberculatus）是我国沿海大型的海洋经济蟹类，我国每年捕捞量在55万吨左右。唐伯平团队获得的三疣梭子蟹基因组大小为1.00Gb，片段重叠群N50的长度为 4.12Mb，被注释到16796个蛋白编码基因，其基因组的完整性为94.7%，整个基因组的重复序列是54.52%。科研人员鉴定出三疣梭子蟹染色体为50对，装配率为97.80%，Hi-C的N50为21.79Mb。这是一个高质量、相当完整的染色体水平基因组，也是蟹类研究中第一次通过分子生物学的方法精确地对蟹类染色体数目进行鉴定。 三疣梭子蟹    唐伯平供图中华绒螯蟹（Eriocheir japonica sinensis）俗称河蟹，是世界上最重要的淡水经济蟹类，目前我国每年河蟹产量为80万吨左右。研究人员获得的中华绒螯蟹基因组大小为1.27Gb，Contig序列N50为3.19Mb，且其GC含量为43%，高于其他节肢动物。BUSCO评估其完整性为94.00%，重复序列在基因组中占61.42%，被功能注释蛋白编码基因22619个。 中华绒螯蟹   唐伯平供图唐伯平团队对甲壳动物中华绒螯蟹、三疣梭子蟹、凡纳滨对虾，昆虫埃及伊蚊、黑腹果蝇、偏瞳蔽眼蝶、蜘蛛等7种节肢动物基因家系展开进一步研究发现，它们共有15503个基因家系，其中8832个基因家系为共有家系，328个和544个基因家系分别唯一存在于三疣梭子蟹和中华绒螯蟹中。在这7种节肢动物中，虾蟹相对进化速率最小，其中对虾进化速度最慢，其次是绒螯蟹和梭子蟹。“相对于昆虫，虾蟹类进化较慢，可能是它们生活的环境相对于昆虫更加稳定。”唐伯平说。 虾蟹系统演化关系和相对进化速率图     唐伯平供图另一个有趣的发现是，虾蟹与昆虫的分化以及螃蟹和对虾的分化几乎是同时发生在4.3亿年左右的志留纪。同属于短尾类的中华绒螯蟹和三疣梭子蟹的分化时间则相对较晚，大约是在1.8亿年前的侏罗纪。我国同时获得1种海洋和1种淡水重要经济蟹类高质量的基因组图谱，将为蟹类和甲壳动物的研究提供重要的理论基础和数据支撑，同时也为经济蟹类育种、养殖和疾病防控工作提供重要的基础平台。相关论文信息：https://doi.org/10.1093/gigascience/giz161https://doi.org/10.3389/fgene.2019.01340

用次氧化锌粉浆液吸收治理低浓度 SO 2 烟气，同时实现次氧化锌粉中伴生有价组元的耦合提取；采用亚硫酸锌浆液的催化氧化方法，同时实现了浆液中 F、Cl 离子的耦合共沉淀；优化创新了高砷含氟、氯物料的硫酸化焙烧脱砷/脱氟/脱氯技术，实现了砷/氟/氯的协同治理；优化创新了铟的富集、提取技术，形成绿色、高效的次氧化锌粉深度治理低浓度 SO 2 烟气耦合提取有价组元新技术。

本发明公开了一种基于 SDN 环境的数据的可靠组播传输方法。 SDN 网络控制器实时监控当前网络状况，在数据传输之前发送端与接 收端先进行三次握手建立连接，连接建立过程中发送端指定接收端， 由 SDN 网络控制器生成组播转发树，连接建立后发送端向该连接发送 数据，数据以组播的方式传输到每个接收端，每个接收端接收到数据 之后向发送端发送确认报文，保证数据可靠传输，同时发送端维护拥 塞窗口，在发送数据的过程中进行拥塞控制

本发明实施例提供一种估计基因组育种值的方法及装置，该方法包括：根据矩阵M‑1的子块数和预设的MPI进程数n，确定MPI进程MPIi读取的根据表型数据文件的记录条数、矩阵A‑1中的个体数和所述MPI进程数n，确定MPI进程MPIi读取的系数矩阵Wi和根据MPI进程MPIi的系数矩阵Wi和确定待估计的基因组育种值。本发明实施例可以实现计算机资源与运算速度的最优化，节约运算时间，提高工作效率。

一直以来，自从第二代高通量测序技术开发至今，基因组测序成本已经降低到3000美元，我们马上就要来到1000 dollar genome 的时代。然而从复杂冗余的基因序列中解读出与疾病相关，与药物相关的重要信息，已经成为当前生物信息学已经成为生物信息学中最重要的挑战。面对该挑战，程容海等人开发了一个在线的个人基因组解码平台（Virtual Pharmacist）。它可以支持分析目前主流的生物信息学数据格式，并且通过该软件后台的数据库和算法，挖掘出个人基因组中的基因突变（Single Nucleotide Polymorphism）与药物反应的关联性分析。该平台只需要用户上传SNP数据文件，或者是高通量测序文件便可以自动完成包括生物信息学分析，基因组信息解读（genomic interpretation），并最终呈现给用户一份详细的，用户友好的，关于195种药物反应的基因检测报告。