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西安交大科研人员开发微卫星不稳定性检测新方法,助力肿瘤精准检测
微卫星不稳定性(Microsatellite Instability, 简称MSI)是目前肿瘤临床检测中一种非常重要的分子表型,多发生于结直肠癌、胃癌、和子宫内膜癌。微卫星不稳定性与肿瘤的发生、发展,治疗方案制定及治疗效果预测相关,更是肿瘤免疫治疗疗效预测的重要分子标记物。当前,临床上使用的两种微卫星不稳定性检测的金标准方法:MSI-PCR和MSI-IHC,都需要专业技术人员通过实验操作来完成,均费时费力且成本较高。近年来,随着高通量测序(Next Generation Sequencing)的发展,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方法开始显露头角,在检测结果与两种临床金标准保持高度一致的情况下,极大的缩减了检测时间并减少了检测成本,大幅提高了推广微卫星不稳定性检测的可行性。2014年,西安交大叶凯教授团队率先开发了基于高通量测序的微卫星不稳定性检测方案——MSIsensor。2017年该检测方案作为全世界首个泛肿瘤检测方案MSK-IMPACT中的微卫星不稳定性计算方法,通过了美国食品药品监督管理局的严格测试并获得批准。美国纪念斯隆凯特琳癌症中心测试表明,基于高通量测序的微卫星不稳定性检测与金标准的一致性可达99.4%。然而,微卫星不稳定性检测方案大都要求提供病人的癌症组织样本及一份取自血液或者癌症组织附近的正常样本。一方面,这一份正常对照样本限制了微卫星不稳定性的应用场景,尤其难以应用于血癌样本、福尔马林包埋样本、PDX/PDO等不易获得正常对照样本的情况;另一方面,额外的对照样本增加了微卫星不稳定性的检测成本。基于上述原因,在叶凯指导下,叶凯青年科学家工作室科研人员经过两年的探索,从微卫星不稳定性发生机理出发,通过数学模型抽象,从单个肿瘤样本中提取特征,开发了MSIsensor-pro。MSIsensor-pro实现不依赖正常对照样本的微卫星不稳定性检测,只需50个微卫星位点的测序数据即可实现微卫星不稳定性的精准检测。MSIsensor-pro的开发扩大了微卫星不稳定性的应用范围,减低了微卫星不稳定性检测的成本。同时MSIsensor-pro在低肿瘤纯度和低测序深度这类低信噪比数据中也显示出来很大的潜力。 该研究成果近期发表在国际组学和生物信息学领域权威期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》(影响因子6.597)上。叶凯的博士生贾鹏为该论文的第一作者,叶凯为通讯作者,西安交通大学为本文唯一通讯作者单位。这是叶凯教授课题组在基因组暗物质解析方面的又一重要突破。论文链接为:https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1672022920300218
西安交通大学 2021-04-10
兰州大学科研团队在祁连山未来气候变化预估研究方面取得新进展
兰州大学资源环境学院,西部教育部重点实验室勾晓华教授团队利用“协调区域气候降尺度试验”CORDEX-CORE框架中使用的德国区域气候模式REMO在三个不同CMIP5全球气候模式驱动下生成的25km分辨率的模拟数据集,基于观测资料对区域气候模式在历史时期1971—2000年的模拟性能进行评估的基础上,预估了祁连山地区2011—2100年在RCP2.6和RCP8.5情景下年平均和季节气温和降水的变化。
兰州大学 2022-06-15
【新闻动态】重庆大学四项成果获2019高校科研优秀成果奖(科学技术)
重庆大学共有4项获奖项目。其中牵头3项,包含科技进步一等奖1项,自然科学二等奖1项,科技进步二等奖1项。同时我校作为参研单位获科技进步二等奖1项。
重庆大学 2019-12-25
基于换道行为的主线收费站ETC指示标志设置安全距离计算方法
本发明公开了一种基于换道行为的主线收费站ETC指示标志设置安全距离计算方法,包括如下步骤:1、计算驾驶员开始对ETC指示标志的内容进行读取的位置到驾驶员开始准备实施换道、减速等行动的位置之间的距离L1;2、计算驾驶员开始对ETC指示标志的内容进行读取的位置到ETC指示标志所在位置之间的距离L2;3、计算驾驶员开始准备实施换道、减速等行动的位置到驾驶员完成换道、减速等行动准备通过闸机的位置之间的距离L3;4、计算ETC指示标志前置距离L4,L4=L1+L3?L2;5、计算具体ETC收费车道布置方案对应的ETC指示标志设置安全距离f(N,n)max。该方法提供了一种针对ETC与MTC共存的主线收费站ETC指示标志设置安全距离计算方法。
东南大学 2021-04-11
一种卫星信号的电离层传播时延的时域数值计算方法
本发明提供了一种卫星信号的电离层传播时延的时域数值计算方法,是一种精确计算电离层中电波 传播时延的方法。具体实现过程步骤包括:步骤(1)对电离层中的理论进行建模。步骤(2)对电磁场 差分迭代公式以及色散媒质的辅助变量 FDTD 迭代公式进行推导;分析数值稳定性与数值色散的关系, 确定合适的时间步长;设置合理的吸收边界,选取合适的激励源。步骤(3)对算法进行验证与性能分 析。步骤(4)利用算法评估经典校正模型。本发明的方法可用于对现有电离层时延误差校正模型的评 估,并作为更精确与优化的校正模型的理论基础。 
武汉大学 2021-04-13
基于计算科学和多能优化分析的智慧能源云平台关键技术及应用
围绕未来能源需求特性辨识、场站/设备智能监测、能效优化管理3项核心内容,开展研究并提出以下3个核心创新点,创新点一为基于数据驱动的需求侧用能行为特性辨识及容量价值评估方法,有效解决了需求侧用能行为特性分析难度大、精确度差、有效性低的问题,为能源电力系统容量规划和优化投资提供了科学依据;创新点二为基于数据挖掘计算的多元设备状态监测与需求侧能效优化技术,解决了需求侧用能设备运行状态监测能力差、管控水平低的问题,实现提质增效;创新点三为基于数据高效融合计算的场站环境监测及虚拟现实交互技术,有效解决了各种环境参数大量冗余导致的监测结果误差大的问题。 平台可应用于包括智能设备制造与销售、能源设备在线监测、能源设备全寿命周期管理、能源站点智慧运行维护、用能负荷预测、能质能效分析与应用等。
华北电力大学 2022-09-05
一种类奔德斯分解的下垂控制孤岛微电网潮流计算方法
本发明公开一种类奔德斯分解的孤岛微电网潮流计算方法,将孤岛微电网潮流计算分解成通过传统潮流计算子问题和下垂节点更新子问题,对下垂节点进行等效后进行初始化;基于系统角频率,更新负荷和线路阻抗参数;通过传统潮流计算子问题,求解作为平衡节点的下垂节点和作为PV节点的下垂节点的相关变量参数;然后通过系统前后两次迭代状态变量之差来判断算法是否收敛:若收敛,停止迭代获得最终潮流解;若不收敛,通过下垂节点更新子问题,修正或求解作为平衡节点的下垂节点和作为PV节点的下垂节点相关变更参数;以此方式交替迭代,获得最终的
东南大学 2021-04-14
柴油机排气管分支流场测试和三维流场计算分析项目
项目简介 “柴油机排气管分支流场测试和三维流场计算分析”项目由中国船舶重工集团公司 地七一一研究所委托开展。对柴油机排气管分支进行流场进行 PIV(Particle Image Velocimetry)测试,并通过结合数值模拟技术分析排气管分支内的流场结构以及进行优 化改进工作。项目主要解决难点为高速流场的实验台搭建、精确计算以及光学测量。 产品性能、指标 提供柴油机排气管分支在各个工况下
江苏大学 2021-04-14
基于高效聚光与金属网基波纹管相变蓄热的太阳能锅炉节能成套技术研发
成果简介:  成功开发出了在正常太阳能辐射强度条件下能满足全天供热的锅炉-太阳能耦合工作的技术,保证了系统连续稳定运行;开发出了高效太阳能集热阵列(增加基于涂料分解反射聚光效应的高效集热器技术); 研发出一套具有一定生产能力和深入实验、改造能力的金属网基波纹管结构的相变蓄热样机;提高系统单位安装面积的集热量,保证全天候预热软水出水温度80-95
南京工业大学 2021-01-12
科技部公开通报又一批高校医学科研诚信案件调查处理结果
5月24日,科技部公开通报“部分高校医学科研诚信案件调查处理结果情况汇总”。其中,包含终身取消科技计划项目申报资格、取消评审专家等资格9年、取消职称晋升资格2年等措施。
科技部 2022-05-25
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